Die Geschichte von Montbozon reicht bis in die Vorgeschichte zurück, als eine neolithische Station entdeckt wurde. Die Region ist seit Jahrtausenden besiedelt und wurde im 12. Jahrhundert von der Familie de Montbozon besiedelt. Diese Familie besaß eine Propstei, die sich über mehr als 70 Dörfer erstreckte, was die Bedeutung von Montbozon in der lokalen Geschichte verdeutlicht.
